Il n'y a aucun risque de se tromper dans les fichiers : tu aurais eu le message "Size error".
Par contre, il faut les envoyer dans l'ordre, d'abord le fichier flash (er9x.hex) puis le fichier EEPROM.
J'ai changé les fusibles pour que, lors de l'arrivée d'une nouvelle version de er9x.hex, les modèles en EEPROM ne soient pas écrasés : menu "Burn", "Fuses", faire une lecture pour vérifier que tout marche bien avec le bouton "Read Fuses", puis bouton "Reset Fuses EEPROM-PROTECT".
C'est une bonne pratique, malgré celà, de sauver régulièrement ses modèles dans eePe (menu "Burn", "Read EEPROM memory to file").