Contrairement aux batteries Ni-Cd, les batteries lithium-polymère sont écologiques et une fois désactivées, on peut les mettre à la poubelle contenant les déchets non recyclables (pour enfouissement ou incinération).
Pour des raisons de sécurité, il est préférable que les cellules LiPo soit complètement déchargées avant d'être désactivées(cependant, si les cellules sont physiquement endommagées, il ne faut PAS décharger les cellules LiPo avant de les jeter - voir ci-dessous pour les détails).
Les batteries doivent également être froides avant de commencer les opérations de désactivation.